Los equipos que se mencionan a continuación son los que pasaron todas las pruebas (esto es, superaron las etapas previas) y estarán en la Etapa Nacional de la Copa Perú 2022. Esta lista se actualizará a medida que se confirmen más equipos (la enumeración es por orden de clasificación).
1. Deportivo Verdecocha (Ripán - La Unión, Huánuco) (*)
2. Colegio Comercio (Callería - Coronel Portillo, Ucayali) (*)
3. Once Caldas (Huariaca - Pasco, Pasco)
4. Ecosem Pasco (Tinyahuarco - Pasco, Pasco)
5. Deportivo Huancapata (Ambo - Ambo, Huánuco)
6. Bagua Grande FC (Bagua Grande - Utcubamba, Amazonas)
7. Unión Santo Domingo (Chachapoyas - Chachapoyas, Amazonas)
8. Deportivo La Paz (Tournavista - Puerto Inca, Ucayali) (**)
9. Estudiantil CNI (Iquitos - Maynas, Loreto)
10. Comerciantes FC (Belén - Maynas, Loreto)
11. Deportivo Ferrocarril (Zarumilla, Tumbes)
12. San Andrés de Runtu (San Marcos - Huari, Áncash)
13. Independiente San Felipe (Carabayllo - Lima, Lima)
14 .Atlético Bruces (Nuevo Chimbote - Santa, Áncash)
15. Deportivo La Victoria (Abancay, Apurímac)
16. Paz Soldán FBC (Aucallama - Huaral, Lima)
17. Social El Olivo (Abancay, Apurímac)
18. Credicoop San Cristóbal (Samegua - Mariscal Nieto, Moquegua) (*)
19. Leoncio Prado (Pampas de Hospital - Tumbes, Tumbes)
20. Deportivo UNH (Ascensión - Huancavelica, Huancavelica) (*)
21. Deportivo Vianney (Ascensión - Huancavelica, Huancavelica)
22. Deportivo Lute (Lagunas - Chiclayo, Lambayeque)
22. Deportivo La Balsa (Pítipo - Ferreñafe, Lambayeque)
23. Deportivo Maldonado (Tambopata, Madre de Dios)
24. Defensor La Bocana (Sechura, Piura)
25. CESA (San Agustín de Cajas - Huancayo, Junín)
26. Atlético Municipal (Iñapari - Tahuamanu, Madre de Dios)
27. Los Libertadores (San Clemente - Pisco, Ica)
28. Unión San Martín (Pisco, Ica) (*)
29. Atlético Torino (Pariñas - Talara, Piura)
30. Mariscal Nieto (Ilo, Moquegua)
31. Atlético Porvenir Nueva Esperanza "Los Tucos" (Oyotún - Chiclayo, Lambayeque)
32. Real Sociedad (Chugay - Sánchez Carrión, La Libertad) (*)
33. Atlético Verdún (San José - Pacasmayo, La Libertad)
34. Defensor Cubillas (Espinar, Cusco)
35. Virgen de la Natividad (Tacna).
36. Nacional FBC (Mollendo - Islay, Arequipa) (*)
37. Los Tigres (Cayma, Arequipa)
38. Deportivo Universitario (Puno)
39. Estrella Azul (Ventanilla, Callao)
40. Luis Escobar (Ventanilla, Callao)
40. Juventud Palmeiras (Mi Perú, Callao)
41. FBC Cahusiños (San Miguel - San Román, Puno)
42. Cultural Huracán (Huanta, Ayacucho)
43. Defensor Concepción (Concepción, Junín)
44. Deportivo Garcilaso (Cusco) (*)
45. CIMAC (Bellavista, San Martín)
46. Agua San Martín (Saposoa - Huallaga, San Martín)
47. Sport Cáceres (Jesús Nazareno - Huamanga, Ayacucho)
48. Coronel Bolognesi (Tacna)
49. Deportivo Volante (Bambamarca, Cajamarca)
50. Rosario (Celendín, Cajamarca)
Campeones y subcampeones
Amazonas: Bagua Grande FC y Unión Santo Domingo.
Áncash: San Andrés de Runtu y Atlético Bruces.
Apurímac: La Victoria y Social El Olivo.
Arequipa: Nacional FBC y Los Tigres.
Ayacucho: Cultural Huracán y Sport Cáceres.
Cajamarca: Deportivo Volante y Rosario.
Callao: Estrella Azul y Juventud Palmeiras (ver NOTA).
Cusco: Deportivo Garcilaso y Defensor Cubillas.
Huancavelica: Deportivo Vianney y Deportivo UNH.
Huánuco: Deportivo Verdecocha y Huancapata.
Ica: Unión San Martín y Los Libertadores.
Junín: CESA y Defensor Concepción.
La Libertad: Real Sociedad y Atlético Verdún.
Lambayeque: Los Tucos y Deportivo La Balsa.
Lima: Paz Soldán FBC e Independiente San Felipe.
Loreto: Estudiantil CNI y Comerciantes FC.
Madre de Dios: Deportivo Maldonado y Atlético Municipal.
Moquegua: Credicoop San Cristóbal y Mariscal Nieto.
Pasco: Ecosem Pasco y Once Caldas.
Piura: Atlético Torino y Defensor La Bocana.
Puno: FBC Cahusiños y Universitario de Puno.
San Martín: AD CIMAC y Agua San Martín.
Tacna: Virgen de la Natividad y Coronel Bolognesi.
Tumbes: Deportivo Ferrocarril y Leoncio Prado.
Ucayali: Colegio Comercio y Deportivo La Paz.
En negrita, los equipos con pasado en Primera División.
(*) Equipo que jugó la Copa Perú 2021.
(**) Equipo oriundo de una jurisdicción distinta a la que compite.
NOTA: Luis Escobar fue desafectado de la Copa Perú por no tener Registros Públicos actualizados. Por tal motivo, Juventud Palmeiras tomó su lugar y pasó a ser Callao 2 (Estrella Azul quedó como Callao 1).