Los equipos que se mencionan a continuación son los que pasaron todas las pruebas (esto es, superaron las etapas previas) y estarán en la Etapa Nacional de la Copa Perú 2024.
Sport Bolognesi (Zarumilla, Tumbes)
UD Tacna Libre (Casitas - Contralmirante Villar, Tumbes)
Dolce FC (Puinahua - Requena, Loreto)
Estudiantil CNI (Iquitos - Maynas, Loreto) (*)
Unión Santo Domingo (Chachapoyas - Chachapoyas, Amazonas) (*)
Cajaruro FC (Cajaruro, Amazonas)
Alto Rendimiento (Inambari - Tambopata, Madre de Dios)
AFC Caychihue (Huepetuhe - Manu, Madre de Dios)
Sociedad de Tiro N° 28 (Tinyahuarco - Pasco, Pasco) (*)
Pacífico FC SMP (San Martín de Porres - Lima, Lima)
Real Independiente (Santa María - Huaura, Lima)
Ecosem Pasco (Tinyahuarco - Pasco, Pasco) (*)
Construcción Civil (Huánuco)
FCR San Antonio (San Antonio - Mariscal Nieto, Moquegua)
Municipal de Tingo María (Rupa Rupa, Huánuco)
Deportivo Lute (Lagunas - Chiclayo, Lambayeque)
Hijos del Altiplano y del Pacífico (El Algarrobal - Ilo, Moquegua) (*)
Centro Social Pariacoto (Pariacoto - Huaraz, Áncash)
Alianza Arenal (Moro - Santa, Áncash)
Bentín Tacna Heroica (Alto de la Alianza, Tacna) (*)
Patriotas FC (Coronel Gregorio Albarracín Lanchipa, Tacna)
Deportivo Ucrania (Nueva Cajamarca - Rioja, San Martín)
Biavo FC (Bajo Biavo - Bellavista, San Martín)
Juventud Santo Domingo (Nasca, Ica)
Nacional de La Joya (Santiago, Ica)
San Martín de Fíloque (Olmos, Lambayeque)
Social Deportivo Florida (Ocobamba - Chincheros, Apurímac)
Miguel Grau (Abancay, Apurímac) (*)
Scratch FC (Bellavista, Callao)
Amazon Callao FC (Callao)
VIARGOCA FC (Atico - Caravelí, Arequipa)
Señor de Quinuapata FC (Ayacucho)
Nuevo San Cristóbal (Pichari - VRAE, Ayacucho) (**)
Atlético Juventud Inclán (Calca, Cusco) (*)
Juventud Alfa FC (Písac - Calca, Cusco)
Juventus FC (Huamachuco - Sánchez Carrión, La Libertad)
El Inca (Chao - Virú, La Libertad)
Juventud Unión Soratira (San Antón - Azángaro, Puno)
Cultural Tambillo (Ituata - Carabaya, Puno)
Rauker FC (Callería - Coronel Portillo, Ucayali)
Real von Humboldt (Alexander von Humboldt - Padre Abad, Ucayali)
Deportivo Municipal (Vice - Sechura, Piura)
Juventud Cautivo (San Miguel de El Faique - Huancabamba, Piura)
FC Cajamarca (Cajamarca) (*)
Sport Machete (Lircay - Angaraes, Huancavelica)
Municipal de Pangoa (Pangoa - Satipo, Junín)
Deportivo Sucre (Huancán - Huancayo, Junín)
Nacional FBC (Mollendo - Islay, Arequipa) (*)
Defensor José María Arguedas (Andahuaylas, Apurímac)
Cultural Volante (Bambamarca, Cajamarca)
UDA (Ascensión, Huancavelica)
Juventud Progreso (Wánchaq, Cusco)
Campeones y subcampeones
Amazonas: Unión Santo Domingo y Cajaruro FC.
Áncash: CS Pariacoto y Alianza Arenal.
Apurímac: Miguel Grau y Defensor José María Arguedas.
Arequipa: VIARGOCA FC y Nacional FBC.
Ayacucho: Señor de Quinuapata y Nuevo San Cristóbal.
Cajamarca: FC Cajamarca y Cultural Volante.
Callao: Scratch FC y Callao FC.
Cusco: Juventud Progreso y Juventud Alfa.
Huancavelica: UDA y Sport Machete.
Huánuco: Construcción Civil y Municipal de Tingo María.
Ica: Juventud Santo Domingo y Nacional de La Joya.
Junín: Municipal Pangoa y Deportivo Sucre.
La Libertad: Juventus FC y El Inca.
Lambayeque: Deportivo Lute y San Martín de Fíloque
Lima: Real Independiente y Pacífico SMP.
Loreto: Estudiantil CNI y Dolce FC.
Madre de Dios: Alto Rendimiento y AFC Caychihue.
Moquegua: FCR San Antonio e Hijos del Altiplano y del Pacífico.
Pasco: Sociedad de Tiro N° 28 y Ecosem Pasco.
Piura: Juventud Cautivo y Municipal de Vice.
Puno: Juventud Unión Soratira y Cultural Tambillo.
San Martín: Deportivo Ucrania y Deportivo Biavo.
Tacna: Bentín Tacna Heroica y Patriotas FC.
Tumbes: Sport Bolognesi y UD Tacna Libre.
Ucayali: Rauker FC y Real von Humboldt.
(*) Equipo que jugó la Etapa Nacional de la Copa Perú 2023.
(**) Equipo oriundo de una jurisdicción distinta a la que compite.